上海海洋大学教授李晨虹团队为为环境DNA（eDNA）定量技术的应用提供了新思路，有望提升eDNA在物种监测、生态评估及生物多样性研究中的应用精度，未来可进一步拓展至更广泛的生境和目标物种，并优化其在实际生态监测中的应用策略。2月6日，相关研究以封面文章的形式发表于《分子生态资源》。
eDNA是指生物体释放至体外环境中的DNA 片段，借助eDNA进行生物监测，是一种高效、灵敏且对生物无损伤的技术手段，在生物多样性评估、濒危物种保护以及入侵生物监测等领域展现出了巨大的应用潜力。然而，eDNA 浓度与环境中生物量之间的相关性较弱，eDNA技术只能判断“有没有鱼”，很难说清楚“有多少鱼”。
研究团队从基因序列差异的角度入手，探讨eDNA 与物种数量之间的关系。具体而言，环境中同一物种的不同个体DNA 序列会出现一定程度差异，个体数量越多，序列差异越大。
研究人员首先通过模拟数据验证分离位点数量在eDNA定量分析中的可行性。统计分析结果表明，在三种不同突变频率的模拟数据中，分离位点数量与序列数量均呈现出极显著的正相关性，且基因突变频率越高，该相关性越强。
经过对比筛选，研究团队决定选用具有较高的遗传多样性，并且易于饲养的矛尾刺虾虎鱼开展进一步实验。结果显示，相较于DNA拷贝数，分离位点数量与样本个体数之间的正相关性更强，表明“差异点数”与鱼的数量匹配度显著高于传统DNA浓度法，且不受鱼是否进食、体型胖瘦的影响。
李晨虹表示，团队开发的基于分离位点数的eDNA定量方法，优于当前主流的eDNA拷贝数法，不受物种体型、摄食行为等环境变量的干扰，能够更加稳定、精准地评估目标物种的数量。
相关论文信息：https://doi.org/10.1111/1755-0998.14076
本文链接：http://www.gihot.com/news-8-1974-0.html说清“有多少鱼”，科学家让生态监测更“聪明”
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