12月11日，记者从中国农业科学院深圳农业基因组研究所获悉，该所联合国内多家单位成功构建了茶树首个泛基因组图谱，同时完成了22个茶树品种的测序。相关研究成果日前发表在国际权威期刊《自然·植物》上。
茶树是重要的经济作物，传统茶树育种主要通过杂交和自然变异选育优良品种，育种周期长。如何更加精确、高效地育种一直是茶树育种家关注的焦点。利用泛基因组辅助育种技术，有望实现更快速的植物性状改良。
“研究选取了22个能最大化代表茶树遗传多样性和表型多样性的茶树品种，包括大叶茶、小叶茶和白毛茶进行测序组装，得到了完整的茶树泛基因组图谱。结合图形泛基因组、群体基因组学以及代谢组数据进行综合分析，研究还鉴定到多个影响茶叶风味性状的等位变异（在一个基因或基因组中发现的新发生的突变或变异形式），进一步揭示了茶树基因组扩张的遗传基础；鉴定得到多个与茶叶颜色、香气等农艺性状相关的关键基因，为茶树育种打下重要基础。”论文通讯作者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员张兴坦告诉科技日报记者。
据悉，茶树泛基因组图谱的构建更新了大众对茶树基因组的认识，包括蛋白编码基因数以及遗传变异对茶树表型的影响。该研究不仅为茶树基因组和重要性状的演化提供新见解，而且为茶树重要基因挖掘和遗传育种提供了重要平台资源和信息，为加速茶树育种进入全基因组设计时代奠定了重要基础。
12月11日，记者从中国农业科学院深圳农业基因组研究所获悉，该所联合国内多家单位成功构建了茶树首个泛基因组图谱，同时完成了22个茶树品种的测序。相关研究成果日前发表在国际权威期刊《自然·植物》上。
茶树是重要的经济作物，传统茶树育种主要通过杂交和自然变异选育优良品种，育种周期长。如何更加精确、高效地育种一直是茶树育种家关注的焦点。利用泛基因组辅助育种技术，有望实现更快速的植物性状改良。
“研究选取了22个能最大化代表茶树遗传多样性和表型多样性的茶树品种，包括大叶茶、小叶茶和白毛茶进行测序组装，得到了完整的茶树泛基因组图谱。结合图形泛基因组、群体基因组学以及代谢组数据进行综合分析，研究还鉴定到多个影响茶叶风味性状的等位变异（在一个基因或基因组中发现的新发生的突变或变异形式），进一步揭示了茶树基因组扩张的遗传基础；鉴定得到多个与茶叶颜色、香气等农艺性状相关的关键基因，为茶树育种打下重要基础。”论文通讯作者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员张兴坦告诉科技日报记者。
据悉，茶树泛基因组图谱的构建更新了大众对茶树基因组的认识，包括蛋白编码基因数以及遗传变异对茶树表型的影响。该研究不仅为茶树基因组和重要性状的演化提供新见解，而且为茶树重要基因挖掘和遗传育种提供了重要平台资源和信息，为加速茶树育种进入全基因组设计时代奠定了重要基础。
本文链接：http://www.gihot.com/news-2-262-0.html首个茶树泛基因组图谱发布
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