拉所有原始数据研究者“入伙”,这项研究为啥这么干?

10个月前 来源:中国科学报 观看:116

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4年前,新入职北京大学生态研究中心的研究员华方圆和团队“001”号成员、科研助理王玮亦开启了一项全球尺度的生物多样性数据分析,想探究是什么因素在影响着鸟类群落对农业毁林的响应。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

这项研究尽管核心成员极为精简,但他们邀请了所有原始数据研究的第一作者和通讯作者作为本研究的共同作者,其中包含澳大利亚新南威尔士大学、野生生物保护学会(WCS)、清华大学等来自全球6个大洲21个国家的49个研究机构,这样的合作方式并不常见。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

但研究人员表示:“这不仅极大地促进了数据的整理工作,也是对原文作者在原始数据收集中付出努力的一个公正地认可。”v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

近日,这项研究成果发表于《自然-生态与进化》。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

寻找数据合作团队v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

2019年底,突如其来的一场疫情,让刚刚入职北大的华方圆被困在家中,野外考察一时搁浅。一天早晨,一个多年前曾好奇的问题突然从她脑海中冒了出来——森林生态系统的生物多样性受农业毁林负面影响的程度与农耕文明之间是否有潜在关联。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

人类上万年的农业史就是一部改造自然的历史。如今地球上已有约40%的无冰土地被转变为农业用地。这种转变,尤其是对森林的转变(即农业毁林),已经成为了全球生物多样性面临的最为严峻的威胁之一。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

目前,已有大量的研究记录了生物多样性对农业毁林的负面响应。“但具体到不同地区的不同案例时,这种响应却表现出了很大的差异,有的研究甚至认为农业毁林对当地的生物多样性是有积极作用的。”论文共一兼通讯作者华方圆说,随着全球农业持续扩张的趋势,理解农业毁林对生物多样性影响的差异、以及背后可能存在的规律,对于深入认识农业的生态影响、进而为管理该影响提供科学依据具有很大科学和应用意义的问题。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

要想探究这种差异,全球范围的数据收集工作成为了这项研究的先行条件。在动植物类群里,鸟是被人类认识最充分的一个类群,研究数据也最为丰富。于是,团队从最初与鸟类相关的近3000篇论文,聚焦到符合数据准入标准的 61 篇文章,一一联系论文作者,最终拿到了47 篇文章的原始数据。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

负责数据收集的论文共一作者王玮亦谈到,整个数据收集工作就持续了近1年半的时间。“并不是所有符合我们准入标准的论文都提供了我们需要的物种尺度数量数据。即使是那些提供了数据的论文,数据格式也千差万别,且在一些关键信息上可能是模糊的。”于是,王玮亦在数据整理过程中,不得不向原文作者逐一发邮件沟通,寻求数据,并多次核实相关细节。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

为了说服、激励原文作者提供数据,研究团队决定让这些作者联合署名,对那些已经在发表文章中提供数据的作者,团队也同样发出了署名邀请。“这样的正式合作模式不仅极大地促进了数据的整理工作,也是对原文作者在原始数据收集中付出努力的一个公正地认可。”王玮亦告诉《中国科学报》。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

发现自然界的“历史遗留效应”v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

数据收集之后的分析与诠释工作同样十分漫长。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

在此前的研究中,科学家一般把生物多样性对农业毁林响应的差异归因于农业景观和生产方式上的不同特征。例如很多研究发现在景观异质性更低、管理强度更高的农业系统中,生物多样性对农业毁林的响应往往更加负面,反之亦然。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

而在这项研究中,科研人员引入了一个“过滤”的概念,即生态过滤机制可能也对这样的差异形成起到了至关重要的作用。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

华方圆解释说,过滤可以大致分为两方面:在天然时空变异性更大的森林生态系统中,比如冠层不连续、有季节性落叶、会发生周期性野火的森林生态系统,物种和群落可能具有预先的对毁林所致生境改变的适应;这是一种自然过滤过程。而那些历史上人为毁林强度更高的地方,存留下来的物种和群落已经经过了一定程度的毁林过程筛选,因此可能也会更加具有耐受性;这是一种人为过滤过程。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

过滤对物种和群落毁林耐受性的影响很少有人研究。为了填补这一空缺,研究团队汇编了一套全球范围内配对的农业系统与原生森林中物种尺度鸟类多度的数据集,对两种生态过滤机制的影响进行了检验。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

结果显示,自然和人为过滤越强,群落的性状就越偏向使物种表现出更高的耐受性。研究人员发现,整体而言,鸟类群落对于农业毁林的响应是近于中性的。然而,如果只看出现在原生森林中的鸟类,农业毁林对它们造成的是显著的负面影响。之所以整体近于中性响应是由那些仅出现在农业系统中的鸟类“拉平”的,它们是农业毁林的“赢家”,但真正需要保护和关注的其实应该是依赖于原生森林的“输家”们。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

华方圆表示,这一结论是从历史遗留效应的视角来认识生物多样性对农业毁林的响应,这将有助于更好地预测和应对未来农业驱动的土地利用变化带来的生物多样性影响。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

研究还强调了要保护现存的完整森林的重要性。因为这些森林迄今为止经历的人为过滤强度比较低,也就是“输家”物种们最后的庇护所。一旦它们遭到破坏,不仅会导致更严重的生物多样性丧失,还会进一步强化人类活动在全球生态系统中造成的历史遗留。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

让数据物尽其用v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

除了论文成果,这项接近4年的研究课题也让华方圆对科研合作的问题有一些更深的思考。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

在论文写作的阶段,如何针对全球尺度的数据讲好多层次的生态演化故事是伴随着投稿的过程而逐渐清晰起来的。“团队虽然经历了2次拒稿、2次修改,每一次修改都是牵一发而动全‘数’,但也在这个繁琐的过程中,一次次收到了世界各地共同作者们的帮助和鼓励。”王玮亦坦言,是全球同行间真诚的交流给了团队成长的养分。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

华方圆告诉《中国科学报》,这项研究最大的难点在于,收集数据的过程也是经营一个学术共同体的过程,如何把庞大的作者群凝聚到同一个目标当中,关系到这项研究的成败。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

在她看来,当下生态学研究领域数据共享机制的设立至关重要。数据公开不仅是科学研究公开透明的体现,同时它也作为一种公共资源,通过共享,让其他研究团队能据此产出更多的科学发现,要让科学数据物尽其用。v71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41559-023-02280-wv71即热新闻——关注每天科技社会生活新变化gihot.com

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